Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGA8P53708 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ITGA8P53708 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms