Protein–RNA interactions for Protein: P49643

PRIM2, DNA primase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM2P49643 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRIM2P49643 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms