Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNTBP49356 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNTBP49356 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNTBP49356 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNTBP49356 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNTBP49356 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNTBP49356 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FNTBP49356 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNTBP49356 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNTBP49356 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNTBP49356 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FNTBP49356 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNTBP49356 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNTBP49356 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNTBP49356 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNTBP49356 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNTBP49356 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNTBP49356 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNTBP49356 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNTBP49356 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNTBP49356 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNTBP49356 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNTBP49356 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNTBP49356 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNTBP49356 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FNTBP49356 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FNTBP49356 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FNTBP49356 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FNTBP49356 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FNTBP49356 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNTBP49356 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNTBP49356 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNTBP49356 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNTBP49356 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNTBP49356 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNTBP49356 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FNTBP49356 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
FNTBP49356 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNTBP49356 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNTBP49356 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FNTBP49356 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNTBP49356 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FNTBP49356 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
FNTBP49356 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FNTBP49356 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FNTBP49356 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FNTBP49356 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FNTBP49356 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FNTBP49356 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FNTBP49356 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FNTBP49356 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FNTBP49356 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
FNTBP49356 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms