Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATRXP46100 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 RNF170-202ENST00000319073 1265 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATRXP46100 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRXP46100 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRXP46100 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRXP46100 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRXP46100 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRXP46100 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRXP46100 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRXP46100 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRXP46100 AC007881.1-201ENST00000437460 187 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRXP46100 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRXP46100 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRXP46100 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRXP46100 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRXP46100 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRXP46100 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRXP46100 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRXP46100 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRXP46100 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRXP46100 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRXP46100 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRXP46100 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRXP46100 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRXP46100 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRXP46100 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRXP46100 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRXP46100 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRXP46100 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRXP46100 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRXP46100 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRXP46100 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRXP46100 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRXP46100 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRXP46100 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRXP46100 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRXP46100 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRXP46100 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRXP46100 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRXP46100 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRXP46100 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRXP46100 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRXP46100 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ATRXP46100 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATRXP46100 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATRXP46100 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ATRXP46100 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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