Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTGER3P43115 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms