Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms