Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBP1P32455 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBP1P32455 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBP1P32455 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBP1P32455 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBP1P32455 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBP1P32455 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBP1P32455 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBP1P32455 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBP1P32455 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBP1P32455 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBP1P32455 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBP1P32455 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBP1P32455 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBP1P32455 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBP1P32455 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBP1P32455 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBP1P32455 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBP1P32455 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBP1P32455 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBP1P32455 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBP1P32455 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBP1P32455 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBP1P32455 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBP1P32455 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBP1P32455 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBP1P32455 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBP1P32455 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBP1P32455 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBP1P32455 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBP1P32455 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBP1P32455 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBP1P32455 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBP1P32455 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBP1P32455 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBP1P32455 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBP1P32455 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GBP1P32455 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBP1P32455 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBP1P32455 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GBP1P32455 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBP1P32455 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBP1P32455 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBP1P32455 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBP1P32455 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBP1P32455 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBP1P32455 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBP1P32455 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBP1P32455 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBP1P32455 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBP1P32455 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBP1P32455 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBP1P32455 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBP1P32455 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBP1P32455 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBP1P32455 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBP1P32455 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBP1P32455 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBP1P32455 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBP1P32455 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBP1P32455 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GBP1P32455 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBP1P32455 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBP1P32455 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBP1P32455 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GBP1P32455 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBP1P32455 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBP1P32455 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBP1P32455 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBP1P32455 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBP1P32455 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBP1P32455 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBP1P32455 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GBP1P32455 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GBP1P32455 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GBP1P32455 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
GBP1P32455 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GBP1P32455 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GBP1P32455 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GBP1P32455 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GBP1P32455 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GBP1P32455 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GBP1P32455 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GBP1P32455 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GBP1P32455 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GBP1P32455 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GBP1P32455 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GBP1P32455 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GBP1P32455 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBP1P32455 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBP1P32455 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBP1P32455 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBP1P32455 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBP1P32455 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBP1P32455 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBP1P32455 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBP1P32455 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBP1P32455 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBP1P32455 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GBP1P32455 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms