Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA3P32297 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms