Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXC13P31276 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.2 ms