Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB2P29033 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB2P29033 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB2P29033 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB2P29033 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB2P29033 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB2P29033 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GJB2P29033 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB2P29033 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB2P29033 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB2P29033 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB2P29033 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB2P29033 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB2P29033 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB2P29033 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB2P29033 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB2P29033 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB2P29033 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB2P29033 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB2P29033 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB2P29033 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB2P29033 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB2P29033 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB2P29033 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB2P29033 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB2P29033 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB2P29033 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB2P29033 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB2P29033 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB2P29033 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB2P29033 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB2P29033 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB2P29033 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB2P29033 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB2P29033 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB2P29033 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB2P29033 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB2P29033 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB2P29033 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB2P29033 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB2P29033 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB2P29033 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB2P29033 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB2P29033 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB2P29033 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB2P29033 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB2P29033 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GJB2P29033 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB2P29033 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB2P29033 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB2P29033 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB2P29033 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB2P29033 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB2P29033 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB2P29033 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB2P29033 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB2P29033 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB2P29033 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB2P29033 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB2P29033 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB2P29033 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB2P29033 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB2P29033 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB2P29033 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB2P29033 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB2P29033 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB2P29033 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB2P29033 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB2P29033 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB2P29033 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB2P29033 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB2P29033 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB2P29033 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB2P29033 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB2P29033 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB2P29033 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB2P29033 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB2P29033 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB2P29033 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB2P29033 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB2P29033 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB2P29033 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB2P29033 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB2P29033 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB2P29033 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB2P29033 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB2P29033 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB2P29033 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GJB2P29033 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB2P29033 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB2P29033 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB2P29033 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB2P29033 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB2P29033 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB2P29033 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB2P29033 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB2P29033 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB2P29033 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB2P29033 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJB2P29033 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms