Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HLA-DMAP28067 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms