Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMA5P28066 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.5 ms