Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFKBIAP25963 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms