Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMO2P25791 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO2P25791 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO2P25791 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO2P25791 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO2P25791 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO2P25791 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO2P25791 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO2P25791 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO2P25791 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO2P25791 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO2P25791 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO2P25791 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO2P25791 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO2P25791 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO2P25791 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO2P25791 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO2P25791 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO2P25791 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO2P25791 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO2P25791 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO2P25791 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO2P25791 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO2P25791 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO2P25791 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO2P25791 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO2P25791 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO2P25791 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO2P25791 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO2P25791 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO2P25791 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO2P25791 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO2P25791 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO2P25791 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO2P25791 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMO2P25791 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LMO2P25791 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LMO2P25791 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LMO2P25791 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LMO2P25791 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LMO2P25791 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LMO2P25791 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO2P25791 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO2P25791 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO2P25791 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO2P25791 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO2P25791 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO2P25791 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO2P25791 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO2P25791 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO2P25791 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO2P25791 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO2P25791 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO2P25791 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO2P25791 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO2P25791 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO2P25791 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO2P25791 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO2P25791 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LMO2P25791 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms