Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAV1P15498 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VAV1P15498 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VAV1P15498 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms