Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ODC1P11926 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODC1P11926 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODC1P11926 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODC1P11926 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODC1P11926 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODC1P11926 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ODC1P11926 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODC1P11926 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODC1P11926 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODC1P11926 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODC1P11926 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODC1P11926 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODC1P11926 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ODC1P11926 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODC1P11926 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODC1P11926 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ODC1P11926 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODC1P11926 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODC1P11926 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODC1P11926 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODC1P11926 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODC1P11926 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODC1P11926 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODC1P11926 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODC1P11926 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODC1P11926 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODC1P11926 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODC1P11926 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODC1P11926 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODC1P11926 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODC1P11926 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODC1P11926 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ODC1P11926 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ODC1P11926 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODC1P11926 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODC1P11926 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ODC1P11926 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODC1P11926 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODC1P11926 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODC1P11926 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODC1P11926 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ODC1P11926 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODC1P11926 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODC1P11926 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ODC1P11926 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODC1P11926 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODC1P11926 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODC1P11926 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODC1P11926 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ODC1P11926 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODC1P11926 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ODC1P11926 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ODC1P11926 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ODC1P11926 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ODC1P11926 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ODC1P11926 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ODC1P11926 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ODC1P11926 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ODC1P11926 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ODC1P11926 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ODC1P11926 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODC1P11926 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ODC1P11926 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODC1P11926 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODC1P11926 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODC1P11926 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ODC1P11926 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODC1P11926 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODC1P11926 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODC1P11926 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ODC1P11926 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ODC1P11926 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ODC1P11926 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODC1P11926 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODC1P11926 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODC1P11926 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODC1P11926 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODC1P11926 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODC1P11926 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODC1P11926 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODC1P11926 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODC1P11926 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODC1P11926 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODC1P11926 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODC1P11926 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODC1P11926 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODC1P11926 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODC1P11926 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ODC1P11926 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODC1P11926 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODC1P11926 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ODC1P11926 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODC1P11926 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ODC1P11926 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODC1P11926 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODC1P11926 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODC1P11926 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODC1P11926 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ODC1P11926 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms