Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SFTPCP11686 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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