Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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