Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TMIGD3P0DMS9 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMIGD3P0DMS9 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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