Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRCP08575 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRCP08575 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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