Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PRKCGP05129 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms