Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNAP02545 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNAP02545 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNAP02545 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNAP02545 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNAP02545 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNAP02545 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNAP02545 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNAP02545 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNAP02545 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNAP02545 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNAP02545 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNAP02545 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNAP02545 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNAP02545 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNAP02545 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNAP02545 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNAP02545 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNAP02545 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNAP02545 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNAP02545 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNAP02545 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNAP02545 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNAP02545 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNAP02545 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNAP02545 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNAP02545 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNAP02545 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNAP02545 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNAP02545 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNAP02545 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNAP02545 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNAP02545 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LMNAP02545 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMNAP02545 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNAP02545 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNAP02545 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNAP02545 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNAP02545 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNAP02545 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNAP02545 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNAP02545 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNAP02545 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNAP02545 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNAP02545 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNAP02545 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNAP02545 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMNAP02545 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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