Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SGSM2O43147 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms