Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOC4-APOC2K7ER74 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms