Protein–RNA interactions for Protein: H3BU77

CCDC179, Coiled-coil domain-containing protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC179H3BU77 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 RNF6-203ENST00000381588 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 MFSD11-201ENST00000336509 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 ARHGAP36-202ENST00000370921 2447 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 DACH2-202ENST00000373131 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 LLGL2-205ENST00000577200 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 ERP44-201ENST00000262455 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 EPB41L1-203ENST00000373941 2652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 UBIAD1-202ENST00000376810 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 UNC13D-202ENST00000412096 3648 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 ZNF461-204ENST00000588268 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 ZNF287-202ENST00000395825 3208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 MAGED1-202ENST00000375695 2875 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 TSPYL1-201ENST00000368608 3326 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 FOXO4-202ENST00000374259 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 ADGRF3-202ENST00000333478 3896 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 FER1L4-208ENST00000611673 3860 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 PELO-201ENST00000274311 4349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 SPAG5-201ENST00000321765 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 AC080128.2-201ENST00000641520 11863 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 PCSK9-201ENST00000302118 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 KLF6-207ENST00000542957 4537 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 KIAA1324-203ENST00000369939 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 SATB2-AS1-205ENST00000450728 3314 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 THUMPD3-206ENST00000452837 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 FER1L5-206ENST00000624922 6367 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 ZNF423-204ENST00000562520 4018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 MPPE1-202ENST00000317235 2324 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 CACNA1C-219ENST00000399649 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 STAT6-205ENST00000543873 3119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 CEP83-208ENST00000547575 3122 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 NSD2-205ENST00000382892 7706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 TMEM198B-202ENST00000478241 2924 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 ANKRD34A-201ENST00000606888 3613 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 AP1G2-202ENST00000397120 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 LRTM2-201ENST00000299194 3688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 MTMR3-202ENST00000333027 8906 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 LILRB1-202ENST00000396315 2157 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 ITSN1-207ENST00000399338 3115 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 LILRB2-203ENST00000391748 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 HIST1H3G-201ENST00000614378 2411 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 DPF2-202ENST00000415073 2085 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 ELP4-222ENST00000640231 2062 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 RPH3A-202ENST00000415485 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
CCDC179H3BU77 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms