Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PATL2C9JE40 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms