Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EFCAB5A4FU69 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms