Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPDC1A2A3K4 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPDC1A2A3K4 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPDC1A2A3K4 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPDC1A2A3K4 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPDC1A2A3K4 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPDC1A2A3K4 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPDC1A2A3K4 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPDC1A2A3K4 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms