Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
REXO2Q9Y3B8 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms