Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms