Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKSQ9UJT2 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms