Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DUX4Q9UBX2 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DUX4Q9UBX2 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DUX4Q9UBX2 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DUX4Q9UBX2 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DUX4Q9UBX2 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DUX4Q9UBX2 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 AKAP13-202ENST00000394510 9128 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUX4Q9UBX2 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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