Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
DKK2Q9UBU2 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms