Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms