Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARHGAP28Q9P2N2 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms