Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC180Q9P1Z9 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms