Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HACD3Q9P035 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HACD3Q9P035 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms