Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL28Q9NXS3 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms