Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVE4

CCDC87, Coiled-coil domain-containing protein 87, humanhuman

Predictions only

Length 849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC87Q9NVE4 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC87Q9NVE4 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC87Q9NVE4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC87Q9NVE4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC87Q9NVE4 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC87Q9NVE4 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC87Q9NVE4 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC87Q9NVE4 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC87Q9NVE4 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC87Q9NVE4 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC87Q9NVE4 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC87Q9NVE4 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC87Q9NVE4 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC87Q9NVE4 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC87Q9NVE4 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC87Q9NVE4 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC87Q9NVE4 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC87Q9NVE4 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC87Q9NVE4 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC87Q9NVE4 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC87Q9NVE4 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC87Q9NVE4 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC87Q9NVE4 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC87Q9NVE4 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC87Q9NVE4 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC87Q9NVE4 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC87Q9NVE4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC87Q9NVE4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms