Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTNNBIP1Q9NSA3 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms