Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBQLN4Q9NRR5 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBQLN4Q9NRR5 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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