Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPHK2Q9NRA0 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms