Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TIMMDC1Q9NPL8 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TIMMDC1Q9NPL8 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms