Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FANCFQ9NPI8 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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