Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHOJQ9H4E5 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOJQ9H4E5 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms