Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00597Q9H2U6 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms