Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
BHLHE41Q9C0J9 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
BHLHE41Q9C0J9 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms