Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GSDMCQ9BYG8 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms