Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TDRD1Q9BXT4 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD1Q9BXT4 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms