Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 H3F3A-203ENST00000366815 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM106CQ9BVX2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms